Все изменилось на обезлюдевший и разоренной Земле за 14 лет, прошедших после Третьего удара. Синдзи пробуждается от комы и начинает знакомство с новым миром, которое оказывается чрезвычайно болезненным и трудным из-за событий, которых он не помнит. Синдзи пытается самостоятельно восстановить мир и спасти планету от Четвертого удара.

Третий фильм, штормом захвативший киноэкраны Японии, стал самым популярным фильмом цикла, и без того не страдавшего от нехватки зрительского внимания. Но реакция на него была неоднозначной: еще никогда с того времени, как увидели свет финальные серии сериала-первоисточника, Евангелион не вызывал столько споров, не возбуждал столько полярных мнений. Калейдоскоп голосов приводит к единственному возможному выводу: этот фильм — из тех, которые нужно увидеть своими глазами.